Publication:
The investigation of plasma membrane localization of PCDH7 and CLIC4 during cell division

dc.contributor.advisorSıcakkan, Nurhan Özlü
dc.contributor.kuauthorDeğirmenci, Beste Senem
dc.contributor.programMolecular Biology and Genetics
dc.contributor.schoolcollegeinstituteGRADUATE SCHOOL OF SCIENCES AND ENGINEERING
dc.coverage.spatialİstanbul
dc.date.accessioned2026-02-23T13:38:25Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractThe regulation of the plasma membrane during cell division is essential for maintaining membrane dynamics and cortical stability, both of which are critical for the fidelity of cell division. This thesis investigates the underlying mechanism of two mitosis specific plasma membrane-enriched proteins, PCDH7 and CLIC4, and uncovers their importance in coordinating membrane-cytoskeleton interactions. PCDH7 is identified as a regulator of the actomyosin network during cytokinesis, where it facilitates proper cleavage furrow ingression and completion of cytokinesis. Palmitoylation emerges as an essential mechanism in the translocation of PCDH7 to the plasma membrane at the onset of mitosis through its interaction with a palmitoyl acyltransferase, ZDHHC5. Dynamic plasma membrane localization of PCDH7 promotes the activation of essential cytokinetic regulators, such as RhoA and myosin II, which facilitate actomyosin ring constriction and ensure successful cell division. In contrast, CLIC4 plays a dual role in stabilizing membrane dynamics and cortical tension during cytokinesis. My results suggest that CLIC4 may localize to the plasma membrane in a palmitoylation-dependent manner and bind phosphoinositols, such as PI(3,5)P2 and PI(4,5)P2, to regulate membrane-cytoskeleton interactions. Live-cell imaging reveals its sequential recruitment during the bleb life cycle, where it supports membrane stabilization in the expansion phase and maintains cortical integrity. These findings highlight CLIC4's distinct role in coordinating membrane tension and bleb regulation, processes critical for cell shape maintenance during mitotic progression. Together, the work on PCDH7 and CLIC4 advances our understanding of how protein-membrane interactions contribute to cytokinesis and provides a framework for exploring their broader relevance to cellular architecture and function.
dc.description.abstractHücre bölünmesi sırasında plazma membranının düzenlenmesi, hem membran dinamiklerinin hem de kortikal stabilitenin korunması açısından kritik bir öneme sahiptir ve bu süreçler, hücre bölünmesinin doğru bir şekilde tamamlanmasını sağlar. Bu çalışma, mitoz sırasında plazma membranında zenginleşen iki proteinin, PCDH7 ve CLIC4'ün mekanizmalarını incelemekte ve bu proteinlerin membran-iskelet etkileşimlerini düzenlemedeki önemini ortaya koymaktadır. PCDH7'nin, sitokinez sırasında ve kesim oyuğununa yerleşerek aktomiyozin ağının düzenlenmesinde ve bölünmenin tamamlanmasında rol oynadığı gösterilmiştir. Palmitolasyon, PCDH7'nin mitoz başlangıcında plazma membranına yerleşimini sağlayan önemli bir mekanizma olarak öne çıkmaktadır ve bu süreç, palmitol transferaz ZDHHC5 ile etkileşimiyle gerçekleşmektedir. PCDH7'nin dinamik plazma membran lokalizasyonu, aktomiyozin halkasının daralmasını sağlayan RhoA ve miyozin II gibi kritik sitokinetik düzenleyicilerin aktivasyonunu destekleyerek hücre bölünmesinin başarılı bir şekilde gerçekleşmesini sağlamaktadır. Öte yandan, CLIC4, sitokinez sırasında membran dinamiklerinin ve kortikal gerilimin stabilizasyonunda çift yönlü bir rol oynamaktadır. Bulgularımız, CLIC4'ün plazma membranına palmitolasyona bağlı bir şekilde yerleşebileceği ve PI(3,5)P2 ile PI(4,5)P2 gibi fosfoinositollere bağlayarak membran-iskelet etkileşimlerini düzenlediğini göstermektedir. Canlı hücre görüntülemesi, CLIC4'ün kutup membran kabarcıklarının yaşam döngüsü boyunca zamansal dinamiğine bağlı olarak yer alındığını ortaya koymuş, genişleme fazında membranı stabilize ettiği ve kortikal bütünlüğü koruduğu gözlemlenmiştir. Bu bulgular, CLIC4'ün mitoz sırasında hücre şeklinin korunmasında ve membran dinamiklerinin düzenlenmesinde oynadığı ayırt edici rolü vurgulamaktadır. PCDH7 ve CLIC4 üzerine yapılan bu çalışma, protein-membran etkileşimlerinin sitokineze katkısını anlamamıza katkı sağlamakta ve hücresel mimarinin ve fonksiyonun daha geniş kapsamlı araştırılması için bir çerçeve sunmaktadır.
dc.description.fulltextNo
dc.format.extentxvi; 86 leaves : graphics ;30 cm.
dc.identifier.embargoNo
dc.identifier.endpage109
dc.identifier.filenameinventorynoD_2025_024_GSSSH
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14288/32340
dc.identifier.yoktezid941794
dc.identifier.yoktezlinkhttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=5NNqZKwwGohPh6_KCcfp-uWbuNyIc5pwzs9jnM2J6rIHdw1KNE2TjxdIUtJChmWO
dc.keywordsPCDH7 and CLIC4 in cytokinesis
dc.keywordsPalmitoylation-dependent plasma membrane localization
dc.keywordsMembrane-cytoskeleton interactions
dc.language.isoeng
dc.publisherKoç University
dc.relation.collectionKoç University Theses & Dissertations Collection
dc.rightsrestrictedAccess
dc.rights.copyrightsnote© All Rights Reserved. Accessible to Koç University Affiliated Users Only!
dc.subjectCell membranes
dc.subjectCell division
dc.titleThe investigation of plasma membrane localization of PCDH7 and CLIC4 during cell division
dc.title.alternativeHücre bölünmesi sırasında PCDH7 ve CLIC4'ün plazma membranı lokalizasyonunun ve moleküler fonksiyonunun araştırılması
dc.typeDissertation
dcterms.dateAccepted2025-01-10
dspace.entity.typePublication
relation.isAdvisorOfThesis8cae6584-6a76-49e3-b115-249da2fdc758
relation.isAdvisorOfThesis.latestForDiscovery8cae6584-6a76-49e3-b115-249da2fdc758
relation.isParentOrgUnitOfPublication434c9663-2b11-4e66-9399-c863e2ebae43
relation.isParentOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery434c9663-2b11-4e66-9399-c863e2ebae43

Files