Publication:
Notch receptor immune profile of blood and tissue lymphoctyes isolated from pediatric Eosinophilic Esophagitis (EoE) patients

dc.contributor.advisorArıkan, Çiğdem
dc.contributor.kuauthorKhan, Sarah Shamim
dc.contributor.programImmunology
dc.contributor.schoolcollegeinstituteGRADUATE SCHOOL OF HEALTH SCIENCES
dc.coverage.spatialİstanbul
dc.date.accessioned2026-02-23T13:37:31Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractEosinophilic esophagitis (EoE) is a rare esophageal disease characterized by an isolated eosinophilic infiltration within the esophagus. Increasing incidence rates with limited diagnostic and treatment options, has resulted in a dire need for better understanding of this disease. Since dysregulated functioning of the immune cells has been noted during EoE, immunophenotypic studies assessing the esophageal immune environment have become necessary. The crucial role of T cells in the development of EoE, importance of Notch signaling for the development of T cells, understanding of dysregulated Notch signaling during allergic diseases, and the overlap of EoE with certain allergic features, has led to the hypothesis of an aberrant Notch signaling present during EoE. In this study, EoE children (n=17, median age 12 years) and healthy control children (n=7, median age 13 years) were included for elucidating the relation among Notch receptors and immune cells. Lymphocytes isolated from peripheral blood, esophageal and duodenal biopsy samples obtained during esophagogastroduodenoscopy were assessed using flow cytometry. Notch-1, -2, -3 and, -4 receptors were detected on CD45+ lymphocytes, total T cells, CD4+ T cells, CD20+ B cells, memory T cells, MAIT cells and total regulatory T cells. Significant increase of esophageal CD45+ cells was observed during active EoE, when compared to healthy controls and EoE remission patients (p=0.01 and p=0.002, respectively). Significant reductions of Notch receptors on lymphocytes, during active EoE, were noted across PBMCs, esophagus and duodenum, especially for the Notch-1 receptor on MAIT and total Tregs. Topical viscous budesonide treatment helped restore these abnormalities. In terms of histopathological characteristics of EoE and Notch receptors, eosinophil number and active eosinophil degranulation showed strong negative correlations with Notch receptor distributions. These findings suggest that the higher eosinophil levels and eosinophil degranulation, indicative of a severe inflammation, are associated with lower Notch signaling activity in specific lymphocyte subsets, especially in MAIT cells. Additionally, EoE patients with basal cell hyperplasia (BCH) showed less Notch receptors than EoE patients without BCH, highlighting the possible contribution of improper Notch signaling in epithelial barrier dysfunction. In conclusion, this study demonstrates the reduced presence of Notch receptors in key immune cell populations that may serve as a biomarker for disease severity and could lead towards the development of targeted therapies aimed at modulating Notch signaling in EoE. Since this study helps to fill the huge research gap present by being the first study in investigating the distribution of Notch receptors on lymphocytes during EoE, it is crucial to expand this research even further by increasing the sample size, performing deeper immunophenotyping, gene expression and functional studies in order to fully understand this disease.
dc.description.abstractEozinofilik özofajit (EoE), yemek borusunda izole bir eozinofilik infiltrasyonla karakterize nadir bir özofageal hastalıktır. Sınırlı tanı ve tedavi seçenekleriyle artan insidans oranları, bu hastalığın daha iyi anlaşılmasına yönelik acil bir ihtiyaçla sonuçlanmıştır. EoE sırasında bağışıklık hücrelerinin düzensiz işleyişi fark edildiğinden, özofageal bağışıklık ortamını değerlendiren immünofenotipik çalışmalar gerekli hale gelmiştir. EoE gelişiminde T hücrelerinin kritik rolü, T hücrelerinin gelişimi için Notch sinyallemesinin önemi, alerjik hastalıklar sırasında düzensiz Notch sinyallemesinin anlaşılması ve EoE'nin belirli alerjik özelliklerle örtüşmesi, EoE sırasında anormal bir Notch sinyallemesinin mevcut olduğu hipotezine yol açmıştır. Bu çalışmada, Notch reseptörleri ve bağışıklık hücreleri arasındaki ilişkiyi açıklamak için EoE'li çocuklar (n=17, ortanca yaş 12 yıl) ve sağlıklı kontrol çocukları (n=7, ortanca yaş 13 yıl) dahil edilmiştir. Özofagogastroduodenoskopi sırasında elde edilen periferik kan, özofageal ve duodenal biyopsi örneklerinden izole edilen lenfositler akım sitometrisi kullanılarak değerlendirildi. Notch-1, -2, -3 ve -4 reseptörleri CD45+ lenfositler, toplam T hücreleri, CD4+ T hücreleri, CD20+ B hücreleri, bellek T hücreleri, MAIT hücreleri ve toplam düzenleyici T hücrelerinde tespit edildi. Aktif EoE sırasında, sağlıklı kontroller ve EoE remisyon hastalarıyla karşılaştırıldığında özofageal CD45+ hücrelerinde önemli artış gözlendi (sırasıyla p=0,01 ve p=0,002). Aktif EoE sırasında lenfositlerdeki Notch reseptörlerinde, özellikle MAIT ve toplam Treg'lerdeki Notch-1 reseptörü için PBMC'lerde, özofagusta ve duodenumda önemli azalmalar kaydedildi. Topikal viskoz budesonid tedavisi bu anormalliklerin düzeltilmesine yardımcı oldu. EoE ve Notch reseptörlerinin histopatolojik özellikleri açısından, eozinofil sayısı ve aktif eozinofil degranülasyonu Notch reseptör dağılımlarıyla güçlü negatif korelasyonlar gösterdi. Bu bulgular, şiddetli bir inflamasyonun göstergesi olan daha yüksek eozinofil seviyeleri ve eozinofil degranülasyonunun, özellikle MAIT hücrelerinde, belirli lenfosit alt gruplarında daha düşük Notch sinyal aktivitesiyle ilişkili olduğunu düşündürmektedir. Ek olarak, bazal hücre hiperplazisi (BCH) olan EoE hastaları, BCH'si olmayan EoE hastalarına göre daha az Notch reseptörü gösterdi ve bu da epitel bariyer disfonksiyonunda uygunsuz Notch sinyallemesinin olası katkısını vurgulamaktadır. Sonuç olarak, bu çalışma, hastalık şiddeti için bir biyobelirteç görevi görebilecek ve EoE'de Notch sinyallemesini düzenlemeyi amaçlayan hedefli tedavilerin geliştirilmesine yol açabilecek önemli bağışıklık hücresi popülasyonlarında Notch reseptörlerinin azalmış varlığını göstermektedir. Bu çalışma, EoE sırasında lenfositler üzerindeki Notch reseptörlerinin dağılımını araştıran ilk çalışma olması nedeniyle mevcut büyük araştırma boşluğunu doldurmaya yardımcı olduğundan, bu hastalığı tam olarak anlayabilmek için örneklem büyüklüğünü artırarak, daha derin immünfenotipleme, gen ekspresyonu ve fonksiyonel çalışmalar yaparak bu araştırmayı daha da genişletmek büyük önem taşımaktadır.
dc.description.fulltextYes
dc.format.extentxvii; 115 leaves : illustrations; tables ; 30 cm.
dc.identifier.embargoNo
dc.identifier.endpage132
dc.identifier.filenameinventorynoT_2024_072_GSHS
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14288/32278
dc.identifier.yoktezid927492
dc.identifier.yoktezlinkhttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=P3dtmmHrq-mzEcmCLi1CqWK-foG-rP9GhcDn15eTcKdkVvmUCsXJ2gFadaB8AwA4
dc.keywordsEosinophilic esophagitis
dc.keywordsImmunophenotyping
dc.keywordsNotch signaling
dc.keywordsBasal cell hyperplasia
dc.keywordsFibrosis
dc.keywordsFlow cytometry
dc.keywordsMAIT cells
dc.keywordsHistopathology
dc.keywordsLymphocyte isolation
dc.language.isoeng
dc.publisherKoç University
dc.relation.collectionKoç University Theses & Dissertations Collection
dc.rightsrestrictedAccess
dc.rights.copyrightsnote© All Rights Reserved. Accessible to Koç University Affiliated Users Only!
dc.subjectCancer research
dc.subjectCell cycle
dc.subjectCell division
dc.subjectAutophagy
dc.subjectCells survival
dc.titleNotch receptor immune profile of blood and tissue lymphoctyes isolated from pediatric Eosinophilic Esophagitis (EoE) patients
dc.title.alternativePediatrik eozinofilik özofajit (EoE) hastalarından izole edilen kan ve doku lenfositlerinin Notch reseptör bağışıklık profili
dc.typeThesis
dcterms.dateAccepted2024-12-04
dspace.entity.typePublication
relation.isAdvisorOfThesiscd7a27fc-cf07-41ec-a3be-f36e0345f308
relation.isAdvisorOfThesis.latestForDiscoverycd7a27fc-cf07-41ec-a3be-f36e0345f308
relation.isParentOrgUnitOfPublication4c75e0a5-ca7f-4443-bd78-1b473d4f6743
relation.isParentOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery4c75e0a5-ca7f-4443-bd78-1b473d4f6743

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Placeholder
Name:
T_2024_072_GSHS.pdf
Size:
3.84 MB
Format:
Adobe Portable Document Format